Kommunen förvaltar naturreservatet Ören. Övriga reservat förvaltas av Länsstyrelsen eller Skärgårdsstiftelsen (se tabellen nedan). För mer information om skyddad natur i Nynäshamns kommun, se naturvård.

Strandäng på Reveludden
| Namn | Storlek i hektar | Förvaltare |
|---|---|---|
| Häringe-Hammersta | 1 922 (varav c:a 1022 i Nynäshamns kommun) | Skärgårdsstiftelsen |
| Järflotta | 1 050 | Skärgårdsstiftelsen |
| Käringboda | 1 500 | Skärgårdsstiftelsen |
| Reveludden | 2 | Länsstyrelsen |
| Revskär | 2 471 | Länsstyrelsen |
| Rosenlundsskogen | 35 | Länsstyrelsen |
| Slätmossen-Borgberget | 178 | Länsstyrelsen |
| Öja-Landsort | 500 | Skärgårdsstiftelsen |
| Ören | 120 | Kommun |
| Österby | 130 | Länsstyrelsen |